Protein–RNA interactions for Protein: P30047

GCHFR, GTP cyclohydrolase 1 feedback regulatory protein, humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCHFRP30047 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCHFRP30047 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCHFRP30047 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms