Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MARCKSP29966 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MARCKSP29966 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms