Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD40LGP29965 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CD40LGP29965 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms