Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD34P28906 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD34P28906 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD34P28906 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD34P28906 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD34P28906 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms