Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMA2P25787 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA2P25787 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms