Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKCHP24723 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCHP24723 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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