Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CA4P22748 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CA4P22748 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CA4P22748 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CA4P22748 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CA4P22748 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CA4P22748 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA4P22748 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA4P22748 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA4P22748 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CA4P22748 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms