Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CD247P20963 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CD247P20963 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CD247P20963 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CD247P20963 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CD247P20963 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CD247P20963 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms