Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NR1D1P20393 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NR1D1P20393 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms