Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB4AP20338 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB4AP20338 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms