Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCLP19338 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCLP19338 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCLP19338 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCLP19338 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCLP19338 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCLP19338 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCLP19338 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCLP19338 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCLP19338 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCLP19338 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCLP19338 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms