Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GNB3P16520 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GNB3P16520 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GNB3P16520 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GNB3P16520 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms