Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UCHL3P15374 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UCHL3P15374 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UCHL3P15374 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms