Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SLC5A1P13866 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SLC5A1P13866 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms