Protein–RNA interactions for Protein: P13010

XRCC5, X-ray repair cross-complementing protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC5P13010 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XRCC5P13010 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
XRCC5P13010 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms