Protein–RNA interactions for Protein: P12107

COL11A1, Collagen alpha-1(XI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL11A1P12107 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
COL11A1P12107 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL11A1P12107 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms