Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NEFHP12036 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NEFHP12036 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEFHP12036 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEFHP12036 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEFHP12036 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEFHP12036 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEFHP12036 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEFHP12036 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEFHP12036 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEFHP12036 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEFHP12036 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms