Protein–RNA interactions for Protein: P0DI80

SMIM6, Small integral membrane protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM6P0DI80 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMIM6P0DI80 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM6P0DI80 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms