Protein–RNA interactions for Protein: P09884

POLA1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLA1P09884 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
POLA1P09884 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLA1P09884 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLA1P09884 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLA1P09884 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLA1P09884 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
POLA1P09884 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
POLA1P09884 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLA1P09884 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLA1P09884 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLA1P09884 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
POLA1P09884 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
POLA1P09884 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
POLA1P09884 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
POLA1P09884 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
POLA1P09884 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
POLA1P09884 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
POLA1P09884 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms