Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PTPRCP08575 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PTPRCP08575 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PTPRCP08575 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
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