Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MMP3P08254 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MMP3P08254 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MMP3P08254 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MMP3P08254 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MMP3P08254 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MMP3P08254 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MMP3P08254 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MMP3P08254 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms