Protein–RNA interactions for Protein: P06730

EIF4E, Eukaryotic translation initiation factor 4E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EP06730 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EIF4EP06730 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms