Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTMAP06454 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTMAP06454 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTMAP06454 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTMAP06454 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms