Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPTA1P02549 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPTA1P02549 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms