Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NSD2O96028 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD2O96028 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD2O96028 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD2O96028 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NSD2O96028 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NSD2O96028 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NSD2O96028 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NSD2O96028 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NSD2O96028 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD2O96028 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NSD2O96028 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NSD2O96028 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NSD2O96028 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD2O96028 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD2O96028 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD2O96028 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD2O96028 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD2O96028 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD2O96028 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NSD2O96028 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms