Protein–RNA interactions for Protein: O95502

NPTXR, Neuronal pentraxin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTXRO95502 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NPTXRO95502 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NPTXRO95502 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms