Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE4BO95155 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE4BO95155 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms