Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SLIT2O94813 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLIT2O94813 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms