Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF40AO75400 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF40AO75400 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms