Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CSO75390 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CSO75390 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CSO75390 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CSO75390 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CSO75390 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CSO75390 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms