Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP5O75197 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP5O75197 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP5O75197 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP5O75197 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP5O75197 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP5O75197 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRP5O75197 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRP5O75197 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRP5O75197 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRP5O75197 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRP5O75197 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRP5O75197 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms