Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL41O60662 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL41O60662 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms