Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLIN1O60240 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLIN1O60240 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms