Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CREB3O43889 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CREB3O43889 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CREB3O43889 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CREB3O43889 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CREB3O43889 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms