Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HTATSF1O43719 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HTATSF1O43719 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms