Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COCHO43405 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COCHO43405 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COCHO43405 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COCHO43405 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COCHO43405 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COCHO43405 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COCHO43405 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COCHO43405 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COCHO43405 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COCHO43405 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COCHO43405 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COCHO43405 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COCHO43405 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms