Protein–RNA interactions for Protein: O43294

TGFB1I1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB1I1O43294 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TGFB1I1O43294 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TGFB1I1O43294 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms