Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLXNB1O43157 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms