Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MEFVO15553 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MEFVO15553 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MEFVO15553 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MEFVO15553 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MEFVO15553 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms