Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ARPC1BO15143 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ARPC1BO15143 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms