Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNMO15061 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNMO15061 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNMO15061 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SYNMO15061 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SYNMO15061 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
SYNMO15061 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC30.32■■■□□ 2.45
SYNMO15061 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
SYNMO15061 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNMO15061 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNMO15061 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNMO15061 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNMO15061 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNMO15061 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNMO15061 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNMO15061 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNMO15061 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNMO15061 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNMO15061 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNMO15061 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNMO15061 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNMO15061 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNMO15061 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNMO15061 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
SYNMO15061 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SYNMO15061 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms