Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
POLR3AO14802 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR3AO14802 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms