Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRAFD1O14545 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRAFD1O14545 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRAFD1O14545 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRAFD1O14545 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRAFD1O14545 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRAFD1O14545 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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