Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
AGRNO00468 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGRNO00468 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGRNO00468 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGRNO00468 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGRNO00468 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
AGRNO00468 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AGRNO00468 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AGRNO00468 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AGRNO00468 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms