Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GFRA2O00451 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms