Protein–RNA interactions for Protein: O00329

PIK3CD, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CDO00329 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PIK3CDO00329 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PIK3CDO00329 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms