Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIEO00221 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIEO00221 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms