Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PATL2C9JE40 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PATL2C9JE40 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms