Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
B4DXG7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
B4DXG7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
B4DXG7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
B4DXG7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DXG7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DXG7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DXG7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DXG7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DXG7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
B4DXG7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
B4DXG7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
B4DXG7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms