Protein–RNA interactions for Protein: A8MW95

BECN2, Beclin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN2A8MW95 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BECN2A8MW95 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BECN2A8MW95 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms